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2017-03-18 11:18 |
自动信息发布工具，可以访问君笨笨贴吧看看哟组学 ? 进展 市场 人物 公司 会议 下一代测序 首页 ? 组学 ? MTS：新型计算机模块技术或可用于研究DNA和RNA分子的功能及特性 MTS：新型计算机模块技术或可用于研究DNA和RNA分子的功能及特性 来源：生物谷 2014-08-25 09:10 2014年8月25日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，来自北卡罗来纳州立大学的研究人员通过研究开发了一种新型多用途的建模技术，其可以模拟多聚电解质系统，这种模块可以产生新型物质来帮助研究人员研究多聚体（高电解质），比如DNA和RNA的结构，相关研究刊登于国际杂志Macromolecular Theory and Simulations上。研究者Nan Li表示，这种新型技术可以帮助我们模拟大型复杂的高电解质系统；高电解质是一种分子链，当其处于水中时会表现出阳性或者阴性，由于其对环境中的电荷非常敏感，因此高电解质往往用于进行诸如药物运输系统机制等相关研究。研究人员感兴趣的是利用这种新型的计算机模块来高电解质系统的行为，因为这些模块可以用于确定哪些高电解质分子更易于表现出多种用途；而且这种模块也可以用于理解高电解质系统，比如DNA、RNA或合成型离子聚合物的行为。高电解质系统很难被模拟，因为其系统非常大，而且包含有有很多可以和高电解质相互作用的离子，这些离子可以改变其电荷、形状、特性及行为。研究者Li说道，目前的问题就是利用计算机来消除离子和高电解质之间的相互作用，因为研究人员就开发出了文中提到的计算机模块，其可以抵消离子的作用。这种新型的计算机模块技术利用的是一种内在的方法，即内在溶剂离子强度法（ISIS），研究人员可以利用单一的参数来控制模块中离子的效应；利用这种新型技术，研究人员就可以鉴别出潜在的高电解质系统作为候选物来进行应用，随后就可以通过改变系统中离子的含量来控制高电解质的行为，当然就包括研究DNA和RNA分子的功能及特性。（yuyu学院）doi:10.1002/mats.201400043PMC:PMID:An Implicit Solvent Ionic Strength (ISIS) Method to Model Polyelectrolyte Systems with Dissipative Particle Dynamics? Nan K. Li, William H. Fuss andYaroslava G. Yingling* Herein, a new coarse-grained methodology for modeling and simulations of polyelectrolyte systems using implicit solvent ionic strength (ISIS) with dissipative particle dynamics (DPD) is presented. This ISIS model is based on mean-field theory approximation and the soft repulsive potential is used to reproduce the effect of solvent ionic strength. The capability of the ISIS model is assessed via two test cases: dynamics of a single long polyelectrolyte chain and the self-assembly of polyelectrolyte diblock copolymers in aqueous solutions with variable ionic strength. The results are in good agreement with previous experimental observations and theoretical predictions, which indicates that our polyelectrolyte model can be used to effectively and efficiently capture salt-dependent conformational features of large-scale polyelectrolyte systems in aqueous solutions, especially at the salt-dominated regime.
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